|
|
سومین کنفرانس زیست‌شناسی سامانه‌های ایران ؛ 8 و 9 اسفند ماه 1396
|
|
|
| عنوان فارسی |
بررسی تفاوت پروفایل بیان ژنی تومورسرطان سینه متاستاز کرده به مغز با دیگر بافت های ریه، کبد و استخوان |
|
| چکیده فارسی مقاله |
هدف و پیشینه سرطان پستان شایع ترین بدخیمی در زنان است. علت مرگ در این بیماران تومورهای اولیه نیستند بلکه به واسطه فرایند متاستاز تومورهای بعدی در فواصل دورتری از بافت اولیه (پستان) تشکیل شده که علت اصلی مرگ و میر نیز می باشند. لذا در این مطالعه تلاش شده است پروفایل بیان ژن های ماکرواری تومورهای مختلف ثانویه تشکیل شده در بافت ها مغز، کبد، ریه و استخوان را با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک جهت یافتن مارکرهای اختصاصی هر کدام جهت درمان بهتر و اختصاصی تر هر تومور با یکدیگر مقایسه شد. نتایج این مطالعه برای تومور متاستاز شده به مغز نشان داد که 9 ژن اختصاصی در تومور مغز به نسبت تومورهای متاستاز شده به کبد، ریه و استخوان افزایش بیان یافته و همچنین 14 ژن اختصاصی دیگر نیز کاهش بیان یافته اند که به ترتیب ژن های افزایش بیان یافته در عملکردهایی همچون محافظت از کمپلکس همانندسازی فورک و همچنین تنظیم مثبت توپوایزومرازی که هر دو از اختصاصات سلول های توموری فعال می باشند فعالیت می کنند درحالیکه ژن های کاهش بیان یافته در عملکردهای تنظیم تمایز پلاسمای سلولی و فاکتورهای نکروز توموری نقش ایفا میکردند که توسط بافت توموری متاستاز شده به مغز مهار شده اند. در این مطالعه برای اولین بار ژن Col2A1 به عنوان ژن افزایش بیان یافته در تومور متاستاز کرده به مغز در مقابل تومروهای متاستازی کبد، ریه و استخوان گزارش می شود که عملکرد آن در اتصالات اسکلتی جنینی است گزارش شده است. روش داده های توسط دیتابیس Gene Exoression Omnibus (GEO) با شماره دسترسی GSE14018 از پایگاه NCBI استخراج شد این دیتابیس دارای 7 پروفایل بیان ژنی از تومورهای متاستاز کرده سرطان سینه به مغز و همچنین 8 نمونه به استخوان و 5 نمونه به کبد و سپس 16 نمونه به ریه را دارا می باشد که مجموعا دارای 36 نمونه از تومورهای متاستاز کرده به بافت های ذکرشده را در خود جای داده است(Barrett et al., 2013(. داده های بدین صورت مورد آنالیز قرار گرفتند که بافت 7 نمونه مغز به صورت تیمار و 8 نمونه استخوان به عنوان کنترل باهم مقایسه شدند و به همین ترتیب 16 نمونه ریه با مغز و 5 نمونه کبد با مغز همگی توسط نرم افزار GEO2R با یکدیگر مقایسه شدند در نهایت همه لیست ژن های افزایش بیان یافته باهم مقایسه شد و ژن های مشترک افزایش بیان یافته در مغز به نسبت دیگر بافت ها بدست آمد همچنین برای ژن های کاهش بیان یافته نیز اینچنین مقایسه ای شد و ژن های مشترک کاهش بیان یافته نیز بدست آمد سپس توسط ابزار DAVID و همچنین EnrichR آنالیز Gene Ontology انجام گرفت(Huang da et al., 2009(. نتایج نتایج آنالیز بیان ژن ها برای مقایسه تومورهای متاستاز کرده مغز با ریه 53 ژن افزایش بیان یافته و 140 ژن کاهش بیان یافته را نشان داد همچنین در مقایسه با کبد 72 ژن افزایش بیان یافته و 215 ژن کاهش بیان یافته را از خود نشان داد در همین راستا مقایسه مغز با استخوان 97 ژن افزایش بیان یافته 179 ژن کاهش بیان یافته نیز گزارش شد که با کنار هم در نظر گرفتن ژن های افزایش بیان یافته تنها 9 ژن مشترک بین آنها بدست آمد همچنین برای ژن های کاهش بیان یافته تنها 14 ژن مشترک وجود داشت به همین سبب این مشترکات را در ادامه بررسی Gene Ontology کردیم که فعالیت های embryonic skeletal joint morphogenesis و replication fork protection برای ژن های افزایش بیان یافته و همچنین bone development و tumor necrosis factor-mediated signaling pathway برای ژن های کاهش بیان یافته در تومور سرطان سینه متاستاز کرده در مغز گزارش شد. همچنین از بین 9 ژن افزایش بیان یافته مشترک در مغز ژن های COL2A1(Collagen type II alpha 1 chain) و همچنین حضور داشتند که برای اولین بار در تومورهای سرطان سینه متاستاز کرده به مغز گزارش می شوند به همراه ژن LOC101928 که از بین 14 ژن کاهش بیان یافته مشترک تنها ژنی بود که برای اولین بار در این مطالعه گزارش شده است. جدول 1. عملکرد ژن های مشترک تومور سرطان سینه متاستاز کرده به مغز Function of Up-Gene Function of Down-Gene Embryonic skeletal joint morphogenesis Bone development Negative regulation of DNA endoreduplication Regulation of plasma cell differentiation Negative regulation of DNA-dependent DNA replication Tumor necrosis factor-mediated signaling pathway Replication fork protection Negative regulation of macrophage apoptotic process Inner ear morphogenesis Negative regulation of mast cell apoptotic process نتیجه گیری نتایج این مطالعه نشان داد که تومورهای سرطان سینه که به بافت های مختلفی متاستاز می کنند از منظر پروفایل بیان ژنی شرایط یکسانی ندارند که این خود نشان دهنده تفاوت هایی در تومورهایی که منشا یکسانی داشتند می باشد به علاوه اینکه نشان دهنده تاثیرات محیطی است که تومورهای متاستاز کرده از خود نشان می دهند به مانند ژن هایی که در عملکرد Inner ear morphogenesis و یا عملکردهای عصبی که مختص مغز است از خود نشان می دهند و این نوعی انطباق تومور را با محیط خود نشان می دهد به توجه به مباحث فوق برای اولین بار در این مطالعه 3 ژن در تومورهای متاستاز کرده به مغز از سرطان سینه گزارش شدند که به ترتیب COL2A1 به عنوان ژنی که در تومورهای متاستاز کرده در مغزبیانشان نسبت به تومورهای متاستاز کرده به کبد و ریه و استخوان افزایش پیدا کرده است و همچنین ژن LOC101928 که به همین نسبت کاهش بیان را نشان می دهد. کاندیدهای این مطالعه جهت بررسی بیشتر در راستای تشخیص و درمان تومورهایی که به مغز متاستاز کرده اند گزارش شده است. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
|
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
|
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
افسانه یاوری | afsaneh yavari
علی سالاری | ali salari
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://icsb2018.modares.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-64-1&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
|
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
دوره مرتبط |
کنفرانس مرتبط |
فهرست کنفرانس ها
|
