|
|
سومین کنفرانس زیست‌شناسی سامانه‌های ایران ؛ 8 و 9 اسفند ماه 1396
|
|
|
| عنوان فارسی |
ارائه رویکرد ترکیبی جدید در شناسایی ژن های حاوی اطلاعات بیماری سرطان سینه |
|
| چکیده فارسی مقاله |
در طی دو دهه گذشته، ظهور فناوری ریزآرایه DNAفرصت های پزشکی شخصی بسیاری را با استفاده از تجزیه و تحلیل سطوح بیان هزاران ژن به طور همزمان فراهم آورده است. با استفاده از طبقه بندی این مجموعه داده ها، اطلاعات مفصلی درباره آرایش ژنتیکی هر بیمار می توان فراهم کرد و به این ترتیب بالقوه دقت تصمیم گیری های پزشکی که توسط پزشکان انجام می شود، بهبود بخشیده می شود. با این حال، مشکل عمده در این تجزیه تحلیل ها تعداد زیادی از ژن ها در مقایسه با تعداد بسیار محدودی نمونه افراد است. درصورتی که برای هر بیماری تنها تعداد کمی از ژن ها حاوی اطلاعات مهم می باشد؛ و همین امر، کار انتخاب ویژگی در مجموعه داده های زیرآرایه را به چالشی مهم تبدیل کرده است. برای این امر، در این پژوهش یک روش ترکیبی سه مرحله ای پیشنهاد شده است؛ که مرحله اول شامل یک فیلتر وزن دهی بازگشتی همبستگی شرایط (RCCW) می باشد، که در گام بعدی ژن های باقی مانده از این فیلتر از نظر معیار کمترین افزونگی و بیشترین همبستگی (MRMR) مورد سنجش قرار می گیرند و در آخر ژن های حاصل از این گام به یک روش Wrapperکه شامل ژنتیک الگوریتم با استفاده از طبقه بندی کننده ماشین بردار پشتیبان (SVM) می باشد، اعمال می شود. روش پیشنهادی بر روی مجموعه داده ریزآرایه سرطان سینه پیاده سازی شده است و عملکرد آن در مقایسه با روش های معتبر و هم راستای دیگر ارزیابی شد. نتایج ها حاکی از آن است که این روش در مقایسه با سایر روشهای تک منظوره یا دو منظوره پیشین به درصد صحت و دقت پیش بینی بسیار قابل قبول (100درصد دقت) و تعداد معقولی ژن حاوی اطلاعات مهم (5 ژن) به طور همزمان دست یافته است. در نهایت عملکرد ژن های انتخاب شده در این مجموعه داده به لحاظ زیست شناختی بیشتر مورد بررسی قرار گرفتند و تأیید شد که 80% ژن های انتخاب شده از لحاظ پزشکی عامل بیماری معرفی شده اند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
|
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
|
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
سجاد ازگلی |
دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)
فرشته اسلامی |
دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)
محمد صنیعی آباده |
دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://icsb2018.modares.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-94-1&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
|
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
دوره مرتبط |
کنفرانس مرتبط |
فهرست کنفرانس ها
|
