|
|
نخستین کنفرانس بین المللی و دهمین کنگره ملی علوم باغبانی ایران
|
|
|
| عنوان فارسی |
بررسی ESTهای ثبت شده در بانک ژن برای تشخیص و شناسایی EST-SSR در انگور |
|
| چکیده فارسی مقاله |
توالیهای نشانه بیان شونده (ESTs) منابع مهمی برای جنبههای مختلف مطالعات ژنومی از قبیل کشف ژن، بیان ژن، ژنومیکس مقایسهای، و توسعه نشانگرهای مولکولی میباشند. در مطالعه حاضر، ESTهای گیاه انگور (Vitis vinifera) ثبت شده در بانک ژن NCBI مورد ارزیابی قرار گرفتند تا توالیهای تکراری موجود در آنها مورد بررسی قرار گیرد تا بتوان نشانگرهای EST-SSR جدیدی را شناسایی کرد. در مجموع 511690 توالی مورد بررسی قرار گرفت که از بین آنها 9236 توالی (میانگین 8/1% از توالیهای ثبت شده) حداقل دارای یک توالی تکراری بودند. از بین موتیفهای مختلفی که مورد آنالیز قرار گرفت، تکرارهای دو نوکلئوتیدی با دارا بودن بیش از 45% توالیهای تکراری، فراوانترین تکرار بودند و بعد از آن به ترتیب تکرارهای سه نوکلئوتیدی (33%) و چهار نوکلئوتیدی (22%) در رتبههای بعدی قرار داشتند. در بین تکرارهای دو نوکلئوتیدی هم توالی AG/GA/CT/TC با حدود 46% از این توالیها، فراوانترین توالی بود. بر اساس توالیهای تکراری ساده شناسایی شده، آغازگرهای مناسب برای تکثیر برخی از EST-SSRهای عملکردی طراحی گردید. ارزیابی این آغازگرها روی برخی از ارقام انگور کشور در حال بررسی میباشد. |
|
| کلیدواژههای فارسی مقاله |
انگور، نشانگرهای مولکولی، EST، SSR |
|
| عنوان انگلیسی |
|
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
|
|
| کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
Abdolkarim Zarei -
Aziz Ebrahimi -
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://www.irhc2017.org |
| فایل مقاله |
دریافت فایل مقاله |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
|
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
دوره مرتبط |
کنفرانس مرتبط |
فهرست کنفرانس ها
|
